Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie



German/Russian Network


Sino/German Network

Projekt Entwicklung eines web-basierten Informationssystems für molekularbiologische Daten
WiSe 13/14

Veranstaltungsdaten

Dozent Dr. Benjamin Kormeier
Vorlesung Mi. 16 - 18 Uhr in D5-113
Umfang 4 SWS (3 LP)
Beleg-Nr. 392251

Veranstaltungssinhalt

Motivation

Molekularbiologische Untersuchungen erzeugen heutzutage eine Vielzahl von Informationen. Die meisten Forschungsergebnisse und Daten werden in Datenbanken gespeichert. Die große Herausforderung ist es nun biologische Funktionen von Genen zu bestimmen, sowie die Interaktionen im Metabolismus zu verstehen. Es gibt bereits Datenbanken, z.B. KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), die ein breites Wissen an biologischem Wissen und an dem Metabolismus beteiligten biologischen Elementen beinhalten. Jedoch ist das meist bei speziellen und komplexen Systemen nicht ausreichend. Aus diesen Gründen soll ein Data Warehouse geschaffen werden, in dem Wissenschaftler in biologische und metabolische Informationen leicht und verständlich aus einem integrierten System abrufen können.

Ziel

Das Ziel dieses Projektes besteht darin, neue Datenquellen in das BioDWH Data Warehouse und DAWIS-M.D. Informationssystem zu integrieren, um einen umfangreichen Zugriff auf ein weites Spektrum von biologischen Daten zu gewährleisten.

Weiterführende Links

Voraussetzung

  1. Datenbankkenntnisse (Anwendungen, SQL)
  2. Exzellente Java Kenntnisse (Swing, Hibernate)
  3. Themenspezifisches Hintergrundwissen (biologische Grundlagen)
  4. Bearbeitung englischsprachiger Fachliteratur

Literaturempfehlungen