Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




German/Russian Network


Sino/German Network

Teaching in WiSe 2012/13


392146   Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke    
Vorlesung   Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113   Hofestädt
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Shoshi
    Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petrinetzen vorgestellt. Anschlie?end erfolgt eine Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren.

In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.

   
392144 Parallele Algorithmen und Datenverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: S2-143   Hofestädt
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113 / C5-153   Braun
    Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt.

Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet.

    Weitere Informationen
392148   Petri-Netze   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

1. Vorbesprechung: Mo, 8.10.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mo, 22.10.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
392222   AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik    
Seminar   Zeit: Do, 11-13 Uhr; Raum: D5-113   Hofestädt
   

 
392171   Message Passing Programming   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

   
392178   Parallele Netzwerkanalyse in der Bioinformatik   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: C5-153  
   

   
392250   Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke   Kormeier
Projekt   Zeit: n.V.  
    Vorbesprechung: Mi, 17.10.2012 15 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
392251   Entwicklung eines web-basierten Informationssystems für molekularbiologische Daten   Kormeier
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
    Vorbesprechung: Mi, 17.10.2012 16 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
209818   Forschungsmodul (prakt.): Genom- und Postgenomforschung an ausgew. Beispielen   Anselmetti, Dierks, Dietz, Flaschel, Giegerich, Hofestädt, Niehaus, Noll, Sewald, Staiger, Stoye, Weisshaar, Kruse, Patschkowski, Kaltschmidt, Kaltschmidt, Lutter, Tauch, Wendisch, Müller, Kalinowski
Projekt
Seminar+Projekt
  Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

   
392158   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Hofestädt, Shoshi
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
   

1. Vorbesprechung: Mo, 8.10.2012, 11.30 Uhr s.t.; Raum D5-113
2. Vorbesprechung: Mo, 15.10.2012, 11.30 Uhr s.t.; Raum D5-113

   
392170   CELLmicrocosmos Cell Modelling   Sommer
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: C5-151  
   

Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen beschäftigt. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier möglich.

Vorbesprechung: 10.10.2012, 14.00 c.t., Raum: C5-151

    Weitere Informationen
392116   3D Stereoscopic Visualization   Sommer
Seminar   Zeit: Mi., 10 c.t. - 12; Raum: C5-151  
   

Seitdem die 3D-Stereoskopie Einhalt nicht nur in die örtlichen Kinos, sondern auch in die ersten Wohnzimmer gehalten hat, ist ihr Siegeszug nicht mehr aufzuhalten. Während viele Universitäten (sowie auch die Uni Bielefeld) schon lange und in vielen Bereichen mit dieser Technik arbeiten, war es ein langer Weg zu den Verbrauchern. So wollen wir uns in diesem Seminar u.a. mit der Geschichte, dem Status Quo und der Zukunft der 3D Stereoskopie auseinandersetzen.

Vorbesprechung: 10.10.2012, 10.00 c.t., Raum: C5-151

    Weitere Informationen