Teaching in WiSe 2008/09
392115 | Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke | |||
Vorlesung | Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-142 | Hofestädt | ||
Übung | Zeit: Do. 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113 | Kormeier | ||
Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petrinetzen vorgestellt. Anschlie?end erfolgt eine Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren. In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung. | ||||
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392117 | Parallele Algorithmen | |||
Vorlesung | Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: S2-143 | Hofestädt | ||
Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 / C5-153 | Braun | ||
Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt. Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet. | ||||
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392112 | Datenbanken I | |||
Vorlesung | Zeit: Do., 14 - 16 Uhr; Raum: H3 | Töpel | ||
Übungen | Zeit: Di., 14 - 16 Uhr in E01-108; Di., 16 - 18 Uhr in S2-137; Mi., 8 - 10 Uhr in S2-143; Mi., 12 - 14 Uhr in C0-259; Mi., 16 - 18 Uhr in S2-137 | Töpel, Tutoren | ||
In der Vorlesung werden die folgenden Schwerpunkte gesetzt: grundlegende DB-Konzepte, Architekturen von DBS, Datenbankmodelle für den Entwurf und Realisierung, relationaler Datenbankentwurf, Datenbankdefinition und -anfragen mit SQL, Anwendungsprogrammierung. In der Übung werden die Inhalte der Vorlesung anhand von Übungsaufgaben vertieft. | ||||
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392116 | Seminar Petri-Netze | Hofestädt | ||
Seminar | Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: Mi., 14.10.2008; 11 Uhr; Raum D5-113 Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten. | ||||
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392126 | Analyse metabolischer Netze | Hofestädt | ||
Seminar | Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: Mi., 14.10.2008; 12 Uhr; Raum D5-113 Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Analyse metabolischer Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten. | ||||
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392140 | Integration und Analyse von Life-Science-Daten basierend auf einem Data Warehouse | Kormeier | ||
Projekt | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: Mi., 14.10.2008; 16 Uhr; Raum D5-113 | ||||
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392147 | Parallele Datenverarbeitung | Braun | ||
Projekt | Zeit: n.V.; Raum: C5-153 | |||
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392134 Projekt |
CELLmicrocosmos 4.1 Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: C5-151 |
Hofestädt, Sommer | ||
Vorbesprechung: Mi., 22.10.2008; 14:00 Uhr c.t.; Raum C5-151 Das interdisziplin�re CELLmicrocosmos-Projekt besch�ftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung und Visualisierung von Zellen. Cm 4.1 baut auf den Ergebnissen einiger vorhergehender Projekte auf: Ein Zelleditor, der dreidimensionale abstrakte Zellmodelle erstellt, wurde in einem ersten Ansatz mit metabolischen Pfaden verkn�pft. Hierzu sollen nun unterschiedliche Layout-Verfahren und Algorithmen untersucht und implementiert werden ... | ||||
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392151 | Projekt Bioinformatik | Giegerich, Hofestädt, Stoye | ||
Projekt | Zeit: n.V.; Raum: n.V. | |||
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392187 Seminar |
Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113 |
Hofestädt | ||
Ausgewählte Themen der Bioinformatik | ||||
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