Teaching in WiSe 2007/08




392115	Modellierung und Simulation metabolischer Netzwerke
Vorlesung	Zeit: Mo, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-243	Hofestädt
Übung	Zeit: n.V.; Raum: D5-113	Kormeier
	Die Vorlesung gibt einen Überblick über die existierenden Modellansätze zur Modellierung metabolischer Netzwerke. Insbesondere wird die regelbasierte Modellierung sowie die Modellierung mit Petrinetzen vorgestellt. Anschlie?end erfolgt eine Überblick über die verfügbaren Datenquellen im Internet sowie die verfügbaren Simulatoren. In dieser Übung werden verschiedene Themen aus der Vorlesung vertieft behandelt und praktisch nachvollzogen. Schwerpunkte der Übung sind: Design molekularer Datenbanken, dynamische Modellierung von Pathways und Datenvisualisierung.
	Weitere Informationen

392117	Parallele Algorithmen
Vorlesung	Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: T2-233	Hofestädt
Übung	Zeit: Do. 10 - 12 Uhr, Fr. 10 - 12 Uhr; Raum: D5-113	Braun
	Ausgangspunkt ist die Definition paralleler Algorithmen. Grundlegende theoretische Modelle der parallelen Datenverarbeitung werden vorgestellt (z.B. Schaltkreise, P-RAM). Der Entwurf paralleler Algorithmen wird diskutiert. Grundkonzepte parallele Architekturen werden vorgestellt. Parallele Algorithmen auf der Grundlage des "message passing" Konzeptes werden in der Übung am verfügbaren Parallelrechner implementiert und getestet. Material zur Vorlesung und Übung: /vol/lehre/ParalleleAlgorithmen/WS07-08
	Weitere Informationen

392130	Message Passing Programming	Braun
Projekt	Zeit: n.V.; Raum: C5-153
	Vorbesprechung: Do., 25.10.2007; 16 Uhr c.t.; D5-113
	Weitere Informationen

392111	Datenbanken I
Vorlesung	Zeit: Do., 14 - 16 Uhr; Raum: H5	Töpel
Übungen	Zeit: Di., 14 - 16 Uhr in T2-226; Di., 16 - 18 Uhr in T2-228; Mi., 8 - 10 Uhr in U2-135; Mi., 16 - 18 Uhr in C0-259	Töpel, Tutoren
	In der Vorlesung werden die folgenden Schwerpunkte gesetzt: grundlegende DB-Konzepte, Architekturen von DBS, Datenbankmodelle für den Entwurf und Realisierung, relationaler Datenbankentwurf, Datenbankdefinition und -anfragen mit SQL, Anwendungsprogrammierung. In der Übung werden die Inhalte der Vorlesung anhand von Übungsaufgaben vertieft.
	Weitere Informationen

392112	Data Warehousing in der Bioinformatik: Methoden und Systeme	Töpel, Kormeier
Seminar	Zeit: Mi., 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113
	Im Rahmen dieser Veranstaltung wird grundlegende und weiterführende Literatur im Bereich von Data-Warehouse-Systemen aufgearbeitet und insbesondere der Einsatz dieser Technologie in Bereich der Bioinformatik untersucht. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.
	Weitere Informationen

392116	Zellulare Automaten	Hofestädt
Seminar	Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: D5-113
	Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Zellulare Automaten" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten. Vorbesprechung: Do., 18.10.2007; 16 Uhr s.t.
	Weitere Informationen

392132 Projekt	CELLmicrocosmos 3.1 Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: C5-151	Hofestädt, Sommer
	Das CELLmicrocsomos-Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung und Visualisierung von Zellen. Wie der Titel mit dem Zusatz 3.1 schon vermuten lässt, baut dieses Projekt auf CELLmicrocosmos 3.0 auf. Ziel war es, einen Zelleditor für unterschiedliche Zelltypen (z.B. Hepatozyten, Pflanzenzellen) zu planen und zu programmieren. Diese erste rudimentäre Version ist in der Lage, eine Kombination aus drei-dimensionalen Zellkomponent-Modellen (z.B. Zellkern, Zellmembran) und PDB-Zellmembran-Strukturmodellen zu erstellen. Die Visualisierung und Navigation durch dieses 3D-Modell soll anschließend mit Hilfe unseres Labor-Equipments erfolgen. Vorbesprechung: Mittwoch, 24.10.2007, 14:00 Uhr c.t., Raum C5-151 Weitere Infos siehe Aushang
	Weitere Informationen

392134	Interaktive 3D-Visualisierung biomedizinischer Daten	Töpel, Kormeier
Projekt	Zeit: Mi., 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113

	Weitere Informationen

392187 Seminar	Arbeitsgemeinschaft Bioinformatik Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113	Hofestädt
	Ausgewählte Themen der Bioinformatik
	Weitere Informationen