Teaching in SoSe 2013
392187 Seminar |
AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik Zeit: Do, 11 - 13 Uhr ; Raum: D5-113 |
Hofestädt | ||
Ausgewählte Themen der Bioinformatik | ||||
392119 | Biomedizinische Informationssysteme | |||
Vorlesung | Zeit: Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113; | Hofestädt | ||
392120 | ||||
Übung | Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113 | Shoshi | ||
Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen
Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem
werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten
gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß
erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich
der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze
werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen
diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden
Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.
Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft. | ||||
392147 | Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken | Hofestädt | ||
Projekt/Projektseminar | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
392150 | Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme | Hofestädt, Shoshi | ||
Projektseminar | Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113 | |||
392105 | Medizinische Wissensverarbeitung | |||
Vorlesung | Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113 | Hofestädt | ||
392106 | ||||
Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | Lewinski | ||
Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt. Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft. | ||||
392250 | Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke | Kormeier | ||
Projekt (Master) | Zeit: Do 16 - 18; Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: Do., 12.04.2013, 16 Uhr s.t.; D5-113 | ||||
392159 | Entwicklung eines web-basierten Informationssystems f�r molekularbiologische Daten | Kormeier | ||
Projekt | Zeit: Mi 16 - 18; Raum: D5-113 | |||
Vorbesprechung: Mi., 11.04.2013, 16 Uhr s.t.; D5-113 | ||||
392171 | Message Passing Programming | Lewinski | ||
Projekt | Zeit: n.V.; Raum: C5-153 | |||
1. Vorbesprechung: Do., 18.04.2013; 14 s.t.; D5-113 | ||||
392232 | Cell Visualization | Sommer | ||
Seminar | Zeit: Mi., 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
In allen Biologie-verwandten Studienf�chern begegnen uns die unterschiedlichsten Visualisierungsans�tze von Zellen: Angefangen von Buch-Illustrationen �ber Filme/Animationen, verschiedenste Arten der Mikroskopie, Lernsoftware und Membransimulationen. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein �berblick und ein erstes Bewertungskonzept zu diesem weitl�ufigen Thema erarbeitet werden. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
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392170 | CELLmicrocosmos Cell Modelling: | Sommer | ||
Projekt | Zeit: Mi., 14 c.t.; Raum: C5-151 | |||
Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen widmet. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier m�glich. Dieses Semester wird der Fokus auf m�glichst realistischer stereoskopischer Animation liegen, wobei unsere PowerWall zum Einsatz kommen wird. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 14.00 c.t., Raum: C5-151 | ||||
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392110 | Interdisziplinäre ZellVisualisierung | Sommer | ||
Vorlesung | Zeit: Fr., 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten ZellVisualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das interdisziplinäre Spektrum reicht von Filmsequenzen �ber Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Edukativen Ans�tzen, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt. Nicht zuletzt wird dabei auch auf die umfangreichen Resultate aus den letzten CELLmicrocosmos-Projekten und -Abschlussarbeiten zur�ckgegriffen werden k�nnen. Vorbesprechung: Mi., 10.04.2013, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
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