Teaching in SoSe 2012
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| 392187 Seminar |
AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113 |
Hofestädt | ||
| Ausgewählte Themen der Bioinformatik | ||||
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| 392119 | Biomedizinische Informationssysteme | |||
| Vorlesung | Zeit: Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113; | Hofestädt | ||
| 392120 | ||||
| Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | Shoshi | ||
| Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen
Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem
werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten
gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß
erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich
der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze
werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen
diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden
Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.
Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft. | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392147 | Fehleranalyse bei molekularen Datenbanken | Hofestädt | ||
| Seminar | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | |||
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1. Vorbesprechung: Mi, 04.04.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113 2. Vorbesprechung: Mi, 11.04.2012, 11 Uhr s.t.; Raum D5-113 | ||||
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| 392153 | Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme | Hofestädt, Shoshi | ||
| Projekt | Zeit: nach Absprache mit den Teilnehmern; Raum: D5-113 | |||
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1. Vorbesprechung: Mi, 04.04.2012, 12 Uhr s.t.; Raum D5-113 2. Vorbesprechung: Mi, 11.04.2012, 12 Uhr s.t.; Raum D5-113 | ||||
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| 392105 | Medizinische Wissensverarbeitung | |||
| Vorlesung | Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: T2-214 | Hofestädt | ||
| 392106 | ||||
| Übung | Zeit: n.V.; Raum: D5-113 | Braun | ||
| Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt. Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft. | ||||
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| 392151 | Projekt Bioinformatik | Giegerich, Hofestädt, Stoye | ||
| Projekt | Zeit: n.V.; Raum: n.V. | |||
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| 392250 | Analyse und Visualisierung biologischer Netzwerke | Kormeier | ||
| Projekt (Master) | Zeit: n.V.; Raum: D-113 | |||
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| 392159 | Datenbanken II | |||
| Vorlesung | Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: S2-137; | Kormeier | ||
| 392160 | ||||
| Übung | Zeit: Di, 12-14; Raum: V0-133 | Kormeier | ||
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Das Modul erweitert und vertieft Datenstrukturen, Algorithmen und Architekturprinzipien von Datenbanksystemen. Dazu werden insbesondere die folgenden Themengebiete behandelt:
Kompetenzen Die Vorlesung vermittelt ein tieferes Verst�ndnis von Datenbanksystemen, ihrem Aufbau, Implementierung und Anwendungen. Die Vorlesung vermittelt ebenfalls Grundlagen zu Techniken des Data Mining und der Datenintegration. Die Behandlung von konkreten Datenbankanwendungen in den Bereichen Semantic Web, Bioinformatik und Multimedia rundet die Vorlesung ab und liefert praxisrelevante Kenntnisse. Die erworbenen Kenntnisse sollen die Studierenden zur (Weiter-) Entwicklung von Datenbanksystemen sowie zur Realisierung nicht-trivialer Datenbankanwendungen bef�higen. | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392171 | Message Passing Programming | Braun | ||
| Projekt | Zeit: n.V.; Raum: C5-153 | |||
Vorbesprechung: 04.04.2012; 14 s.t.; D5-113 In dem Projekt werden Lösungen zu aktuellen Problematiken im Bereich der Programmierung von Message Passing Systemen erarbeitet, die an AG internen Projekten ankn�pfen. Weitere Informationen bzw. die detaillierte Vorstellung der Thematiken erfolgt beim ersten Treffen. | ||||
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| 392232 | Cell Visualization | Sommer | ||
| Seminar | Zeit: 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
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In allen Biologie-verwandten Studienf�chern begegnen uns die unterschiedlichsten Visualisierungsans�tze von Zellen: Angefangen von Buch-Illustrationen �ber Filme/Animationen, verschiedenste Arten der Mikroskopie, Lernsoftware und Membransimulationen. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein �berblick und ein erstes Bewertungskonzept zu diesem weitl�ufigen Thema erarbeitet werden. Vorbesprechung: 04.04.2012, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392170 | CELLmicrocosmos Cell Modelling | Sommer | ||
| Projekt | Zeit: 14 c.t.; Raum: C5-151 | |||
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Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen beschäftigt. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier m�glich. Vorbesprechung: 04.04.2012, 14.00 c.t., Raum: C5-151 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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| 392110 | Interdisziplinäre ZellVisualisierung !NEU! | Sommer | ||
| Vorlesung | Zeit: 10 c.t.; Raum: D5-113 oder C5-151 | |||
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In der Vorlesung werden die unterschiedlichsten ZellVisualisierungsansätze besprochen und analysiert. Gleichzeitig wird Basiswissen im Bereich der Zellbiologie vermittelt werden. Das interdisziplinäre Spektrum reicht von Filmsequenzen �ber Buch-Illustrationen, Webseiten, Datenbanken, Edukativen Ans�tzen, Computerspielen und -programmen. In Relation dazu werden zelluläre Simulationsansätze, wissenschaftliche Publikationen und die durch die Mikroskopie generierte Realität gesetzt. Vorbesprechung: 04.04.2012, 10.00 c.t., Raum: D5-113 | ||||
| Weitere Informationen | ||||
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