Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie




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Teaching in SoSe 2011


392187
Seminar
  AG Seminar Bioinformatik / Medizinische Informatik
Zeit: Do, 11 Uhr ; Raum: D5-113
  Hofestädt
    Ausgewählte Themen der Bioinformatik

    Weitere Informationen
392119 Biomedizinische Informationssysteme    
Vorlesung   Zeit: Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: C01-243; wöchentlich   Hofestädt
392120        
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Shoshi
    Zunächst erfolgt die Definition und Diskussion des klassischen Begriffs der Informationsverarbeitung und der Informationssysteme. Außerdem werden grundlegende Bemerkungen zu Ontologien und Datenaustauschformaten gemacht, sowie relevante Beispiele aus der Praxis vorgestellt. Im Anschluß erfolgt eine Einführung in die typischen Datenquellen im Bereich der molekularen Medizin. Auf der Grundlage unterschiedlicher Integrationsansätze werden existierende Werkzeuge zur Integration heterogener Datenquellen diskutiert. Abschließend wird eine Einführung in die grundlegenden Techniken zur Entwicklung web-basierter Informationssysteme gegeben.

Mit theoretischen und praktischen Übungen werden die Themen der Vorlesung vertieft.

    Weitere Informationen
392153   Konzeption und Implementierung biomedizinischer Informationssysteme   Hofestädt, Shoshi
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

1. Vorbesprechung: Mi., 06.04.2011 12.00 Uhr s.t.; Raum: D5-113

2. Vorbesprechung: Mi., 13.04.2011 12.00 Uhr s.t.; Raum: D5-113

    Weitere Informationen
392105   Medizinische Wissensverarbeitung    
Vorlesung   Zeit: Di, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113   Hofestädt
392106        
Übung   Zeit: n.V.; Raum: D5-113   Braun
    Die medizinische Wissensverarbeitung ist ein wesentliches Gebiet der �Medizinischen Informatik�. Die molekulare Biologie in Kombination mit den Methoden der Bioinformatik hat auch dieses Gebiet in den vergangenen Jahren neu pr�gen k�nnen. Der diagnostische Einsatz der Methoden des fallbasierten Schlie�ens (Case Based Reasoning) sowie der kausal probabilistischen Netze werden in dieser Vorlesung zentral behandelt.

Es werden die Themen der Vorlesung anhand von theoretischen und praktischen �bungsaufgaben vertieft.

    Weitere Informationen
392147   Modellierung mit PetriNetzen   Hofestädt
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113  
    Im Seminar wird grundlegende und weiterführende Literatur zum Thema "Petri-Netze" behandelt. Zu den entsprechenden Themen werden durch die Teilnehmer Vorträge gehalten.

1. Vorbesprechung: Mi., 06.04.2011 11.00 Uhr s.t.; Raum: D5-113

2. Vorbesprechung: Mi., 13.04.2011 11.00 Uhr s.t.; Raum: D5-113

    Weitere Informationen
392151   Projekt Bioinformatik   Giegerich, Hofestädt, Stoye
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: n.V.  
   

    Weitere Informationen
392171   Message Passing Programming   Braun
Projekt   Zeit: n.V.; Raum: C5-153    
   

    Weitere Informationen
392165   Datenbanksysteme und Datenintegration in der Bioinformatik   Kormeier
Seminar   Zeit: Do, 16 - 18 Uhr; Raum: D5-113  
 

1.Vorbesprechung: Do., 07.04.2011 15 Uhr s.t.; Raum: D5-113

2.Vorbesprechung: Do., 14.04.2011 15 Uhr s.t.; Raum: D5-113

    Weitere Informationen
392163   Entwicklung eines web-basierten Informationssystems f�r molekularbiologische Daten   Kormeier
Projekt   Mi, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
 

1.Vorbesprechung: Mi., 06.04.2011 14 Uhr s.t.; Raum: D5-113

2.Vorbesprechung: Mi., 13.04.2011 14 Uhr s.t.; Raum: D5-113

Projekt Folien
    Weitere Informationen
392164   Integration, Verarbeitung und Visualisierung von Life Science Daten   Kormeier
Projekt (Master)   Zeit: Do, 14 - 16 Uhr; Raum: D5-113  
   

1.Vorbesprechung: Do., 07.04.2011 14 Uhr s.t.; Raum: D5-113

2.Vorbesprechung: Do., 14.04.2011 14 Uhr s.t.; Raum: D5-113

    Weitere Informationen
392170   CELLmicrocosmos Cell Modelling   Sommer
Projekt   Zeit: n.V. (siehe Aushang); Raum: C5-151  
   

Das CELLmicrocosmos 1 Projekt beschäftigt sich mit der drei-dimensionalen Modellierung von Zellen, während sich das CELLmicrocosmos 2 Projekt mit der Modellierung und Simulation von Membranen beschäftigt. Sowohl programmiertechnische, datenintegrative als auch 3D-modellierende Aufgabenstellungen sind hier m�glich.

Vorbesprechung: 13.04.2011, 14.00 c.t., Raum: C5-151

    Weitere Informationen
392232   Cell Visualization   Sommer
Seminar   Zeit: n.V.; Raum: D5-113 oder C5-151  
   

Die Visualisierung von Zellen ist ein wichtiges Thema in der Bioinformatik. Verschiedene Projekte besch�ftigen sich mit diesem Thema auf den verschiedensten Ebenen: Angefangen von Schulbuch-Illustrationen �ber Filme, verschiedenste Arten der Mikroskopie und Membransimulation. In diesem Seminar soll im Rahmen von Referaten ein Überblick zu diesem weitläufigen Thema erarbeitet werden.

Vorbesprechung: 13.04.2011, 10.00 c.t., Raum: D5-113

    Weitere Informationen